围绕水源区“生态治理、生态修复、生态保护”三道防线的构筑，以水体修复、林分修复、增殖放流为重点，逐步提升水体内源修复能力。

一是有序推进水库水体生态修复项目，2013年以来投入约1300万元实施东牙溪水库水体生态修复一、二、三期项目。2018年起实施东牙溪水库生物多样性及生态系统质量提升工程，目前项目已完成水上设备安装，待接电调试。

二是实施林分修复改造工程，自2016年起加强库区周边一级保护区内一重山的生态隔离带建设，完成1700亩水源涵养林种植，改善林分结构。

三是开展增殖放流活动，累计在东牙溪水库投放30余万尾鲢鱼苗，5000只棘胸蛙，并以上游中村段为试点，投放多类鱼苗，聘请4名水库辅警加强对库区内的执法监管。提高东牙溪水域水生生物多样性。

四是加强上游河道综合治理。先后实施米洋溪生态修复、东牙溪万里生态水系建设、水土流失治理等项目，对东牙溪干流、张坑溪、焙坑溪、米洋溪等共12.98公里河道进行水环境生态综合治理，在中村村、张坑村、米洋村、前村村等累计新建生态护岸约3公里，穿堤涵管2处，新建修复拦河坝4座，封禁治理141公顷，造林16公顷。同时以“河长制”为抓手，加强河道的管护、监督，近年来共清理河道淤泥2公里，拆除捞砂点9个，整治毛竹加工厂违法行为6项。